Mendi txikia, nahiko zakarra baina itxurosoa da Apategi. Hainbat mendi bizkar luzatzen da Bidasoaren ertzetik Pirineoaren ardatz nagusiraino, garaieran pixkanaka gora eginez hara gerturatu ahala. Horietako batean dago kokatuta Apategi, Etxalar eta Bera artean. Izen bereko errekak inguratzen du iparraldetik eta Errekabeltza izenekoak hegoaldetik; bizkarrean berriz Etxaburu muinoak laguntzen du mendebaldetik eta Zurgaietak mendebaldetik.